Badanie ujawnia unikalną architekturę genetyczną kardiomiopatii przerostowej w populacji chińskiej
Kardiomiopatia przerostowa (HCM, hypertrophic cardiomyopathy) to częsta choroba serca o podłożu genetycznym, najczęściej wynikająca z mutacji w genach związanych z sarkomerem. Choć została szeroko przebadana w populacjach europejskich, jej genetyczne podstawy u osób pochodzenia chińskiego pozostawały dotąd słabo poznane.
W przekrojowym badaniu naukowcy z West China Hospital oraz University of Birmingham przeanalizowali dane z sekwencjonowania całego egzomu u 593 chińskich i 1 232 brytyjskich pacjentów z HCM oraz w grupach kontrolnych. Odkryto, że pacjenci chińscy wykazują istotnie większe obciążenie rzadkimi wariantami genetycznymi (52,8% w porównaniu z 13,6% w populacji brytyjskiej), jednak odsetek wariantów patogennych lub prawdopodobnie patogennych (P/LP) był zbliżony w obu grupach.
Szczególnie interesujące okazały się dwa warianty genów, specyficzne dla populacji chińskiej: MYBPC3 c.3624del oraz TNNT2 c.300C>G, które odpowiadały odpowiednio za 2,9% i 1,5% przypadków HCM. Badanie wykazało również silniejsze powiązania z genami cienkiego filamentu i lekkich łańcuchów miozyny u pacjentów chińskich, podczas gdy u pacjentów brytyjskich dominowały warianty nietrunkujące w genie MYBPC3.
Zastosowanie narzędzia genebe pozwoliło znacząco ograniczyć odsetek wariantów o niepewnym znaczeniu (VUS) do 46,8%, przewyższając skuteczność innych metod klasyfikacji i poprawiając jakość diagnostyki genetycznej.
Autorzy podkreślają, że wyniki te dowodzą potrzeby tworzenia baz danych genetycznych specyficznych dla poszczególnych grup etnicznych oraz stosowania dopasowanych narzędzi interpretacyjnych, co pozwoli uniknąć błędów klasyfikacji i usprawni postępowanie kliniczne w kardiomiopatii przerostowej na całym świecie.
Źródło: Precision Clinical Medicine, Genetic architecture of hypertrophic cardiomyopathy in individuals of Chinese and United Kingdom ancestry
DOI: http://dx.doi.org/10.1093/pcmedi/pbaf019
